Zu den für die Aquakultur anwendbaren analytischen Gentechnologien gehören: DNA-Marker, Genomkartierung, Mikroarrays und Sequenzierung, die unter Fischgenetik und Fischgenom fallen. Menschen und Fische haben viele gemeinsame Entwicklungswege, Organsysteme und physiologische Mechanismen, was Schlussfolgerungen für die Humanbiologie ermöglicht. Die jeweiligen Vorteile von Zebrafisch, Medaka, Tetraodon oder Takifugu wurden bisher mit bioinformatischen Analysen und molekularbiologischen Techniken gut ausgenutzt.